每天上班12小时却只算10小时是否合法，需结合具体情况判断。一般而言，这种做法可能不合法，具体如下：
1. 无特殊工时且未支付加班费：用人单位强制要求员工每天工作12小时，仅按10小时计算，且未支付额外2小时加班费，违法。根据《劳动法》，标准工时每日工作不超过8小时，超出部分应作为加班并支付报酬，即便员工同意，未足额支付加班费仍违法。
2. 特殊工时未审批：如用人单位声称实行不定时或综合计算工时工作制，但未向劳动行政部门申请并获批，仍让员工每天工作12小时只算10小时，违法。特殊工时需审批，否则按标准工时执行。
3. 排除必要工作时间：如用人单位扣除员工上班前准备或下班后收尾等必要工作时间，导致实际工作12小时却只算10小时，违法。工作时间应包括劳动者在用人单位指挥或要求下从事劳动的全部时间。
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处理每天上班12小时只算10小时的问题，需避免以下错误行为：
1. 默默忍受不维权：部分员工因觉得维权麻烦或担心报复，选择默默忍受，可能导致超过一年的劳动争议仲裁时效，合法权益无法受法律保护。
2. 销毁或丢失关键证据：与用人单位产生矛盾后，员工若冲动或不慎销毁、丢失劳动合同、考勤记录等关键证据，后续维权将难以证明每天上班12小时及少算工作时间的事实，影响维权效果。
3. 采取过激行为维权：个别员工维权时情绪激动，采取扰乱生产经营秩序等过激行为，不仅无法解决问题，还可能违法并承担法律责任。若您面临此困扰，建议不要采取上述错误行为，可咨询我为您提供正确的维权方式。
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每天上班12小时只算10小时可能带来以下法律风险：
1. 用人单位面临支付赔偿金风险：若员工每天上班12小时，用人单位仅按10小时计算且未支付加班费，员工维权后，用人单位除需补足加班费外，还可能按应付金额50%以上100%以下的标准支付赔偿金。例如，某公司长期如此，员工仲裁后，公司被裁定补足加班费并加付赔偿金。
2. 员工可能因过度劳累引发健康问题及纠纷：每天12小时远超法定工作时间，员工长期过度劳累易致健康问题。若能证明健康问题与长时间工作存在因果关系，用人单位需承担医疗费用、赔偿等责任。例如，某员工因每天上班12小时只算10小时，过度劳累生病住院，经鉴定与工作时间过长有关，用人单位最终承担部分医疗费用和赔偿。
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针对每天上班12小时只算10小时是否合法的问题，可依据《中华人民共和国劳动法》分析：
《中华人民共和国劳动法》第三十六条规定：“国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。”标准工时下，每天12小时已远超8小时法定上限。根据该法第四十四条，安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资150%的报酬。用人单位让员工每天工作12小时却只算10小时，意味着至少2小时未被计入工作时间或未按加班标准支付报酬，明显违反上述法律规定。即便双方协商一致，也不能违反法律强制性规定，因此该行为不合法。

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